Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pkd2O35245 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pkd2O35245 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pkd2O35245 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pkd2O35245 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pkd2O35245 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Pkd2O35245 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pkd2O35245 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pkd2O35245 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pkd2O35245 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms