Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dctn1O08788 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dctn1O08788 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dctn1O08788 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dctn1O08788 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Dctn1O08788 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dctn1O08788 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms