Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube3aO08759 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3aO08759 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3aO08759 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3aO08759 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms