Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Unc5cO08747 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Unc5cO08747 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Unc5cO08747 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Unc5cO08747 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Unc5cO08747 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Unc5cO08747 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms