Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm379J3QQ19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm379J3QQ19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm379J3QQ19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm379J3QQ19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms