Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4b4J3QNS5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4b4J3QNS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd4b4J3QNS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms