Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21976J3QNN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21976J3QNN2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21976J3QNN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21976J3QNN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms