Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21820J3KMU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21820J3KMU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21820J3KMU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21820J3KMU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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