Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210016F16RikG3X8U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
2210016F16RikG3X8U3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2210016F16RikG3X8U3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms