Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pira2F8VQ94 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pira2F8VQ94 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pira2F8VQ94 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pira2F8VQ94 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms