Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
5830473C10RikF8VQ07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
5830473C10RikF8VQ07 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
5830473C10RikF8VQ07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5830473C10RikF8VQ07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms