Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Ercc6F8VPZ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ercc6F8VPZ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ercc6F8VPZ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ercc6F8VPZ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ercc6F8VPZ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ercc6F8VPZ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ercc6F8VPZ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ercc6F8VPZ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms