Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rfx7F8VPJ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rfx7F8VPJ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rfx7F8VPJ6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rfx7F8VPJ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rfx7F8VPJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms