Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3371F7CQW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3371F7CQW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3371F7CQW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3371F7CQW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3371F7CQW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
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