Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933403O08RikF6UK53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4933403O08RikF6UK53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933403O08RikF6UK53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933403O08RikF6UK53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms