Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phldb3E9QAF4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phldb3E9QAF4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Phldb3E9QAF4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms