Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Urb2E9Q7L1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Urb2E9Q7L1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Urb2E9Q7L1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
Urb2E9Q7L1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Urb2E9Q7L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Urb2E9Q7L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Urb2E9Q7L1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Urb2E9Q7L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms