Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp31E9Q6Y8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp31E9Q6Y8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp31E9Q6Y8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp31E9Q6Y8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp31E9Q6Y8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp31E9Q6Y8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms