Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FancfE9Q5Z5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FancfE9Q5Z5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FancfE9Q5Z5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FancfE9Q5Z5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FancfE9Q5Z5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FancfE9Q5Z5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FancfE9Q5Z5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FancfE9Q5Z5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FancfE9Q5Z5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FancfE9Q5Z5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.1 ms