Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CenpfE9Q3P4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpfE9Q3P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpfE9Q3P4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpfE9Q3P4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms