Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap46E9Q2C0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap46E9Q2C0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap46E9Q2C0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap46E9Q2C0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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