Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Scaf11E9PZM7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Scaf11E9PZM7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Scaf11E9PZM7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Scaf11E9PZM7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Scaf11E9PZM7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Scaf11E9PZM7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms