Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rsf1E9PWW9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rsf1E9PWW9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rsf1E9PWW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rsf1E9PWW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Rsf1E9PWW9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rsf1E9PWW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rsf1E9PWW9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms