Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zscan18E9PUD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan18E9PUD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zscan18E9PUD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zscan18E9PUD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan18E9PUD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zscan18E9PUD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zscan18E9PUD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms