Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Piezo1E2JF22 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Piezo1E2JF22 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Piezo1E2JF22 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Piezo1E2JF22 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Piezo1E2JF22 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Piezo1E2JF22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms