Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
4930407I10RikD3Z5T8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
4930407I10RikD3Z5T8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
4930407I10RikD3Z5T8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
4930407I10RikD3Z5T8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
4930407I10RikD3Z5T8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.82■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms