Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms