Protein–RNA interactions for Protein: D3YYY1

Scgb2b7, ABPBG7, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b7D3YYY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b7D3YYY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b7D3YYY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b7D3YYY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scgb2b7D3YYY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scgb2b7D3YYY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scgb2b7D3YYY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms