Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc170D3YXL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc170D3YXL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc170D3YXL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms