Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp26c1B2RXA7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26c1B2RXA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp26c1B2RXA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp26c1B2RXA7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp26c1B2RXA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp26c1B2RXA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp26c1B2RXA7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp26c1B2RXA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp26c1B2RXA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms