Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700018F24RikB2RW27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
1700018F24RikB2RW27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
1700018F24RikB2RW27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700018F24RikB2RW27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018F24RikB2RW27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms