Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Ythdc2B2RR83 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ythdc2B2RR83 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ythdc2B2RR83 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ythdc2B2RR83 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ythdc2B2RR83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ythdc2B2RR83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ythdc2B2RR83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms