Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf3B2RQG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf3B2RQG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf3B2RQG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf3B2RQG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms