Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed5B2RPU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed5B2RPU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed5B2RPU8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed5B2RPU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed5B2RPU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms