Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tbc1d2B1AVH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tbc1d2B1AVH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2B1AVH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tbc1d2B1AVH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2B1AVH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2B1AVH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms