Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scml2B1AVB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scml2B1AVB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scml2B1AVB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scml2B1AVB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms