Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm14862B1AV28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm14862B1AV28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm14862B1AV28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm14862B1AV28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms