Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtpruB1AUH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtpruB1AUH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtpruB1AUH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtpruB1AUH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtpruB1AUH1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
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