Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Proca1B0QZF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Proca1B0QZF7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Proca1B0QZF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms