Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan4dA7KBS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4dA7KBS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4dA7KBS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zscan4dA7KBS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4dA7KBS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms