Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930435E12RikA6X8Z9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930435E12RikA6X8Z9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms