Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CatsperbA2RTF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatsperbA2RTF1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CatsperbA2RTF1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CatsperbA2RTF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CatsperbA2RTF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatsperbA2RTF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatsperbA2RTF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatsperbA2RTF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatsperbA2RTF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatsperbA2RTF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatsperbA2RTF1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatsperbA2RTF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms