Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtcflA2APF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtcflA2APF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtcflA2APF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtcflA2APF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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