Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT1

Bfsp1, Filensin, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp1A2AMT1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bfsp1A2AMT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bfsp1A2AMT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp1A2AMT1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp1A2AMT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp1A2AMT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms