Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc163A2AGD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc163A2AGD7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc163A2AGD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc163A2AGD7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms