Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Myom3A2ABU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myom3A2ABU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Myom3A2ABU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Myom3A2ABU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.77■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Myom3A2ABU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Myom3A2ABU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Myom3A2ABU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Myom3A2ABU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Myom3A2ABU4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms