Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pramef6A2A8M8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef6A2A8M8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef6A2A8M8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef6A2A8M8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms