Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbf1A2A870 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbf1A2A870 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fbf1A2A870 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbf1A2A870 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms