Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YD13

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YD13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YD13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YD13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YD13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YD13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A286YD13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YD13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YD13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YD13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A286YD13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YD13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YD13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A286YD13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A286YD13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YD13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YD13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A286YD13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms