Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms